Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MCCC2Q9HCC0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCCC2Q9HCC0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCC2Q9HCC0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCC2Q9HCC0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCC2Q9HCC0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCC2Q9HCC0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCC2Q9HCC0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCC2Q9HCC0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCC2Q9HCC0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCC2Q9HCC0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCC2Q9HCC0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCC2Q9HCC0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCC2Q9HCC0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.8 ms