Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC07

TMEM165, Transmembrane protein 165, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM165Q9HC07 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM165Q9HC07 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM165Q9HC07 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM165Q9HC07 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM165Q9HC07 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM165Q9HC07 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM165Q9HC07 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.8 ms