Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PPCSQ9HAB8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPCSQ9HAB8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPCSQ9HAB8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPCSQ9HAB8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPCSQ9HAB8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPCSQ9HAB8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPCSQ9HAB8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPCSQ9HAB8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPCSQ9HAB8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPCSQ9HAB8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPCSQ9HAB8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPCSQ9HAB8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPCSQ9HAB8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPCSQ9HAB8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPCSQ9HAB8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPCSQ9HAB8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPCSQ9HAB8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms