Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ELP3Q9H9T3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ELP3Q9H9T3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ELP3Q9H9T3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms