Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q4

NHEJ1, Non-homologous end-joining factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHEJ1Q9H9Q4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NHEJ1Q9H9Q4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NHEJ1Q9H9Q4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms