Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TAF1DQ9H5J8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TAF1DQ9H5J8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TAF1DQ9H5J8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TAF1DQ9H5J8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TAF1DQ9H5J8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TAF1DQ9H5J8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TAF1DQ9H5J8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TAF1DQ9H5J8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TAF1DQ9H5J8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TAF1DQ9H5J8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TAF1DQ9H5J8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TAF1DQ9H5J8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TAF1DQ9H5J8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TAF1DQ9H5J8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TAF1DQ9H5J8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TAF1DQ9H5J8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TAF1DQ9H5J8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TAF1DQ9H5J8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TAF1DQ9H5J8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TAF1DQ9H5J8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TAF1DQ9H5J8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TAF1DQ9H5J8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TAF1DQ9H5J8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TAF1DQ9H5J8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TAF1DQ9H5J8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TAF1DQ9H5J8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TAF1DQ9H5J8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TAF1DQ9H5J8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TAF1DQ9H5J8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TAF1DQ9H5J8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TAF1DQ9H5J8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TAF1DQ9H5J8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TAF1DQ9H5J8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms