Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SEMA6BQ9H3T3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SEMA6BQ9H3T3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA6BQ9H3T3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms