Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3R2

MUC13, Mucin-13, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC13Q9H3R2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MUC13Q9H3R2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MUC13Q9H3R2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MUC13Q9H3R2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms