Protein–RNA interactions for Protein: Q9H334

FOXP1, Forkhead box protein P1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP1Q9H334 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FOXP1Q9H334 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXP1Q9H334 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
FOXP1Q9H334 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXP1Q9H334 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXP1Q9H334 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXP1Q9H334 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXP1Q9H334 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXP1Q9H334 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159 ms