Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIOBPQ9H2D6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIOBPQ9H2D6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIOBPQ9H2D6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIOBPQ9H2D6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIOBPQ9H2D6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIOBPQ9H2D6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIOBPQ9H2D6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIOBPQ9H2D6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIOBPQ9H2D6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIOBPQ9H2D6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIOBPQ9H2D6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIOBPQ9H2D6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIOBPQ9H2D6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIOBPQ9H2D6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
TRIOBPQ9H2D6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIOBPQ9H2D6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIOBPQ9H2D6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIOBPQ9H2D6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIOBPQ9H2D6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIOBPQ9H2D6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIOBPQ9H2D6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIOBPQ9H2D6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIOBPQ9H2D6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIOBPQ9H2D6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIOBPQ9H2D6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIOBPQ9H2D6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIOBPQ9H2D6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIOBPQ9H2D6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIOBPQ9H2D6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIOBPQ9H2D6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIOBPQ9H2D6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIOBPQ9H2D6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIOBPQ9H2D6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms