Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF3Q9GZM5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
YIPF3Q9GZM5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF3Q9GZM5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms