Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms