Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCSER1Q9C0I3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCSER1Q9C0I3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCSER1Q9C0I3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCSER1Q9C0I3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms