Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP44Q9C0F1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CEP44Q9C0F1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CEP44Q9C0F1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms