Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA4CQ9C0C4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA4CQ9C0C4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA4CQ9C0C4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms