Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM55Q9BYV6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM55Q9BYV6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM55Q9BYV6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms