Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CDHR2Q9BYE9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDHR2Q9BYE9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDHR2Q9BYE9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDHR2Q9BYE9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDHR2Q9BYE9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDHR2Q9BYE9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDHR2Q9BYE9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDHR2Q9BYE9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDHR2Q9BYE9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDHR2Q9BYE9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDHR2Q9BYE9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDHR2Q9BYE9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDHR2Q9BYE9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDHR2Q9BYE9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDHR2Q9BYE9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDHR2Q9BYE9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDHR2Q9BYE9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDHR2Q9BYE9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDHR2Q9BYE9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CDHR2Q9BYE9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CDHR2Q9BYE9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CDHR2Q9BYE9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CDHR2Q9BYE9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.37
CDHR2Q9BYE9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDHR2Q9BYE9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDHR2Q9BYE9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDHR2Q9BYE9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDHR2Q9BYE9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDHR2Q9BYE9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDHR2Q9BYE9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDHR2Q9BYE9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDHR2Q9BYE9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDHR2Q9BYE9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms