Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRRTQ9BXP5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRRTQ9BXP5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SRRTQ9BXP5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRRTQ9BXP5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRRTQ9BXP5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SRRTQ9BXP5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRRTQ9BXP5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRRTQ9BXP5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRRTQ9BXP5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRRTQ9BXP5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRRTQ9BXP5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRRTQ9BXP5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SRRTQ9BXP5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SRRTQ9BXP5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SRRTQ9BXP5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SRRTQ9BXP5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SRRTQ9BXP5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SRRTQ9BXP5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SRRTQ9BXP5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SRRTQ9BXP5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SRRTQ9BXP5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SRRTQ9BXP5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SRRTQ9BXP5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SRRTQ9BXP5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SRRTQ9BXP5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SRRTQ9BXP5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SRRTQ9BXP5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SRRTQ9BXP5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SRRTQ9BXP5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SRRTQ9BXP5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SRRTQ9BXP5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms