Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MTA3Q9BTC8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MTA3Q9BTC8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTA3Q9BTC8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MTA3Q9BTC8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTA3Q9BTC8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTA3Q9BTC8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTA3Q9BTC8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTA3Q9BTC8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTA3Q9BTC8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTA3Q9BTC8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTA3Q9BTC8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTA3Q9BTC8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTA3Q9BTC8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTA3Q9BTC8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTA3Q9BTC8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTA3Q9BTC8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTA3Q9BTC8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTA3Q9BTC8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTA3Q9BTC8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms