Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3GL2Q99962 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3GL2Q99962 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms