Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOTCH4Q99466 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NOTCH4Q99466 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOTCH4Q99466 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOTCH4Q99466 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOTCH4Q99466 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOTCH4Q99466 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOTCH4Q99466 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOTCH4Q99466 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOTCH4Q99466 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOTCH4Q99466 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOTCH4Q99466 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOTCH4Q99466 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOTCH4Q99466 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOTCH4Q99466 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NOTCH4Q99466 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOTCH4Q99466 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOTCH4Q99466 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOTCH4Q99466 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NOTCH4Q99466 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOTCH4Q99466 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOTCH4Q99466 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOTCH4Q99466 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOTCH4Q99466 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOTCH4Q99466 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOTCH4Q99466 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOTCH4Q99466 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms