Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SIN3AQ96ST3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SIN3AQ96ST3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
SIN3AQ96ST3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SIN3AQ96ST3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SIN3AQ96ST3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SIN3AQ96ST3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SIN3AQ96ST3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SIN3AQ96ST3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SIN3AQ96ST3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SIN3AQ96ST3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
SIN3AQ96ST3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SIN3AQ96ST3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SIN3AQ96ST3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
SIN3AQ96ST3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SIN3AQ96ST3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SIN3AQ96ST3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SIN3AQ96ST3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SIN3AQ96ST3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SIN3AQ96ST3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SIN3AQ96ST3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SIN3AQ96ST3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SIN3AQ96ST3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SIN3AQ96ST3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SIN3AQ96ST3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
SIN3AQ96ST3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SIN3AQ96ST3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SIN3AQ96ST3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SIN3AQ96ST3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SIN3AQ96ST3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SIN3AQ96ST3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SIN3AQ96ST3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SIN3AQ96ST3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SIN3AQ96ST3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SIN3AQ96ST3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SIN3AQ96ST3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SIN3AQ96ST3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SIN3AQ96ST3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SIN3AQ96ST3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
SIN3AQ96ST3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SIN3AQ96ST3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SIN3AQ96ST3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SIN3AQ96ST3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SIN3AQ96ST3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SIN3AQ96ST3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SIN3AQ96ST3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SIN3AQ96ST3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms