Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPS6KC1Q96S38 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6KC1Q96S38 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KC1Q96S38 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KC1Q96S38 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms