Protein–RNA interactions for Protein: Q96S06

LMF1, Lipase maturation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMF1Q96S06 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMF1Q96S06 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMF1Q96S06 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMF1Q96S06 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms