Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBGCP5Q96RT8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TUBGCP5Q96RT8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBGCP5Q96RT8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBGCP5Q96RT8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBGCP5Q96RT8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBGCP5Q96RT8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP5Q96RT8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP5Q96RT8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP5Q96RT8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP5Q96RT8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP5Q96RT8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP5Q96RT8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP5Q96RT8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP5Q96RT8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP5Q96RT8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP5Q96RT8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBGCP5Q96RT8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBGCP5Q96RT8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBGCP5Q96RT8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBGCP5Q96RT8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms