Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLIN4Q96Q06 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLIN4Q96Q06 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLIN4Q96Q06 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLIN4Q96Q06 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLIN4Q96Q06 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLIN4Q96Q06 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLIN4Q96Q06 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLIN4Q96Q06 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLIN4Q96Q06 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PLIN4Q96Q06 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLIN4Q96Q06 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLIN4Q96Q06 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLIN4Q96Q06 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLIN4Q96Q06 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLIN4Q96Q06 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PLIN4Q96Q06 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PLIN4Q96Q06 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLIN4Q96Q06 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLIN4Q96Q06 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLIN4Q96Q06 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLIN4Q96Q06 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLIN4Q96Q06 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLIN4Q96Q06 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLIN4Q96Q06 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLIN4Q96Q06 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLIN4Q96Q06 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLIN4Q96Q06 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLIN4Q96Q06 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLIN4Q96Q06 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLIN4Q96Q06 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLIN4Q96Q06 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLIN4Q96Q06 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLIN4Q96Q06 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLIN4Q96Q06 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLIN4Q96Q06 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PLIN4Q96Q06 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms