Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LRRC7Q96NW7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
LRRC7Q96NW7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
LRRC7Q96NW7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRC7Q96NW7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRC7Q96NW7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRC7Q96NW7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRC7Q96NW7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRC7Q96NW7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRC7Q96NW7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LRRC7Q96NW7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRRC7Q96NW7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRRC7Q96NW7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRRC7Q96NW7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRRC7Q96NW7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LRRC7Q96NW7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
LRRC7Q96NW7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRRC7Q96NW7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRRC7Q96NW7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
LRRC7Q96NW7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LRRC7Q96NW7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LRRC7Q96NW7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LRRC7Q96NW7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
LRRC7Q96NW7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LRRC7Q96NW7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
LRRC7Q96NW7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
LRRC7Q96NW7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
LRRC7Q96NW7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
LRRC7Q96NW7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRRC7Q96NW7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRRC7Q96NW7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRRC7Q96NW7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LRRC7Q96NW7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LRRC7Q96NW7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
LRRC7Q96NW7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
LRRC7Q96NW7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LRRC7Q96NW7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LRRC7Q96NW7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LRRC7Q96NW7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LRRC7Q96NW7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LRRC7Q96NW7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LRRC7Q96NW7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LRRC7Q96NW7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LRRC7Q96NW7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LRRC7Q96NW7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LRRC7Q96NW7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LRRC7Q96NW7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LRRC7Q96NW7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LRRC7Q96NW7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
LRRC7Q96NW7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
LRRC7Q96NW7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
LRRC7Q96NW7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LRRC7Q96NW7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
LRRC7Q96NW7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
LRRC7Q96NW7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
LRRC7Q96NW7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
LRRC7Q96NW7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LRRC7Q96NW7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
LRRC7Q96NW7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LRRC7Q96NW7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LRRC7Q96NW7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LRRC7Q96NW7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LRRC7Q96NW7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LRRC7Q96NW7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LRRC7Q96NW7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LRRC7Q96NW7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LRRC7Q96NW7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LRRC7Q96NW7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LRRC7Q96NW7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LRRC7Q96NW7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LRRC7Q96NW7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LRRC7Q96NW7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
LRRC7Q96NW7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
LRRC7Q96NW7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
LRRC7Q96NW7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LRRC7Q96NW7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC34■■■■□ 3.03
LRRC7Q96NW7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LRRC7Q96NW7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
LRRC7Q96NW7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC34■■■■□ 3.03
LRRC7Q96NW7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LRRC7Q96NW7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LRRC7Q96NW7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LRRC7Q96NW7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LRRC7Q96NW7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LRRC7Q96NW7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LRRC7Q96NW7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LRRC7Q96NW7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LRRC7Q96NW7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
LRRC7Q96NW7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LRRC7Q96NW7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LRRC7Q96NW7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LRRC7Q96NW7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LRRC7Q96NW7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LRRC7Q96NW7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LRRC7Q96NW7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
LRRC7Q96NW7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LRRC7Q96NW7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LRRC7Q96NW7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
LRRC7Q96NW7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LRRC7Q96NW7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms