Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FRMD6Q96NE9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD6Q96NE9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms