Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCZQ96LD1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCZQ96LD1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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