Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPZA3Q96KX2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPZA3Q96KX2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPZA3Q96KX2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms