Protein–RNA interactions for Protein: Q96J02

ITCH, E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITCHQ96J02 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms