Protein–RNA interactions for Protein: Q96GJ1

TRMT2B, tRNA (uracil(54)-C(5))-methyltransferase homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2BQ96GJ1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRMT2BQ96GJ1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRMT2BQ96GJ1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRMT2BQ96GJ1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRMT2BQ96GJ1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms