Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP6Q96FZ7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CHMP6Q96FZ7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHMP6Q96FZ7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms