Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ASIC4Q96FT7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASIC4Q96FT7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms