Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CPNE2Q96FN4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CPNE2Q96FN4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CPNE2Q96FN4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CPNE2Q96FN4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CPNE2Q96FN4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CPNE2Q96FN4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CPNE2Q96FN4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CPNE2Q96FN4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CPNE2Q96FN4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CPNE2Q96FN4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CPNE2Q96FN4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CPNE2Q96FN4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CPNE2Q96FN4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CPNE2Q96FN4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CPNE2Q96FN4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CPNE2Q96FN4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CPNE2Q96FN4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CPNE2Q96FN4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CPNE2Q96FN4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CPNE2Q96FN4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CPNE2Q96FN4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CPNE2Q96FN4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CPNE2Q96FN4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CPNE2Q96FN4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CPNE2Q96FN4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CPNE2Q96FN4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CPNE2Q96FN4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CPNE2Q96FN4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CPNE2Q96FN4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CPNE2Q96FN4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms