Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC97Q96F63 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC97Q96F63 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC97Q96F63 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms