Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MVB12AQ96EY5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms