Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC126Q96EE4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC126Q96EE4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms