Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATG4CQ96DT6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATG4CQ96DT6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms