Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
OPTNQ96CV9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
OPTNQ96CV9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
OPTNQ96CV9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
OPTNQ96CV9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms