Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NSUN4Q96CB9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NSUN4Q96CB9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NSUN4Q96CB9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSUN4Q96CB9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSUN4Q96CB9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSUN4Q96CB9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSUN4Q96CB9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSUN4Q96CB9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSUN4Q96CB9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NSUN4Q96CB9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NSUN4Q96CB9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NSUN4Q96CB9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NSUN4Q96CB9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NSUN4Q96CB9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NSUN4Q96CB9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NSUN4Q96CB9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NSUN4Q96CB9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NSUN4Q96CB9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NSUN4Q96CB9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NSUN4Q96CB9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NSUN4Q96CB9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NSUN4Q96CB9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NSUN4Q96CB9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NSUN4Q96CB9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NSUN4Q96CB9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NSUN4Q96CB9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NSUN4Q96CB9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NSUN4Q96CB9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NSUN4Q96CB9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NSUN4Q96CB9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NSUN4Q96CB9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NSUN4Q96CB9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NSUN4Q96CB9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NSUN4Q96CB9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NSUN4Q96CB9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NSUN4Q96CB9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NSUN4Q96CB9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NSUN4Q96CB9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NSUN4Q96CB9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NSUN4Q96CB9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NSUN4Q96CB9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms