Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ULK4Q96C45 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ULK4Q96C45 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ULK4Q96C45 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms