Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RUNDC1Q96C34 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RUNDC1Q96C34 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RUNDC1Q96C34 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RUNDC1Q96C34 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RUNDC1Q96C34 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
RUNDC1Q96C34 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RUNDC1Q96C34 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RUNDC1Q96C34 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RUNDC1Q96C34 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RUNDC1Q96C34 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RUNDC1Q96C34 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RUNDC1Q96C34 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
RUNDC1Q96C34 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RUNDC1Q96C34 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RUNDC1Q96C34 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RUNDC1Q96C34 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RUNDC1Q96C34 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RUNDC1Q96C34 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
RUNDC1Q96C34 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RUNDC1Q96C34 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RUNDC1Q96C34 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RUNDC1Q96C34 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RUNDC1Q96C34 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RUNDC1Q96C34 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RUNDC1Q96C34 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
RUNDC1Q96C34 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
RUNDC1Q96C34 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RUNDC1Q96C34 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms