Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC10Q969S8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms