Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TNRQ92752 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TNRQ92752 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TNRQ92752 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TNRQ92752 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TNRQ92752 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TNRQ92752 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TNRQ92752 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TNRQ92752 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TNRQ92752 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TNRQ92752 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TNRQ92752 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TNRQ92752 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TNRQ92752 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TNRQ92752 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TNRQ92752 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TNRQ92752 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TNRQ92752 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TNRQ92752 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TNRQ92752 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TNRQ92752 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TNRQ92752 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TNRQ92752 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TNRQ92752 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TNRQ92752 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
TNRQ92752 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TNRQ92752 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TNRQ92752 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TNRQ92752 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TNRQ92752 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TNRQ92752 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TNRQ92752 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
TNRQ92752 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
TNRQ92752 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TNRQ92752 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TNRQ92752 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TNRQ92752 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TNRQ92752 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TNRQ92752 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TNRQ92752 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TNRQ92752 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TNRQ92752 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TNRQ92752 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TNRQ92752 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TNRQ92752 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
TNRQ92752 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TNRQ92752 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TNRQ92752 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TNRQ92752 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TNRQ92752 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TNRQ92752 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TNRQ92752 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TNRQ92752 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TNRQ92752 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
TNRQ92752 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TNRQ92752 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC35■■■■□ 3.19
TNRQ92752 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TNRQ92752 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TNRQ92752 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
TNRQ92752 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC35■■■■□ 3.19
TNRQ92752 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TNRQ92752 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TNRQ92752 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TNRQ92752 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TNRQ92752 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TNRQ92752 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TNRQ92752 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TNRQ92752 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TNRQ92752 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TNRQ92752 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TNRQ92752 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TNRQ92752 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TNRQ92752 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TNRQ92752 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TNRQ92752 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TNRQ92752 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TNRQ92752 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
TNRQ92752 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TNRQ92752 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TNRQ92752 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
TNRQ92752 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TNRQ92752 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TNRQ92752 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TNRQ92752 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TNRQ92752 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TNRQ92752 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TNRQ92752 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
TNRQ92752 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TNRQ92752 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TNRQ92752 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
TNRQ92752 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TNRQ92752 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TNRQ92752 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TNRQ92752 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TNRQ92752 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TNRQ92752 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TNRQ92752 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TNRQ92752 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TNRQ92752 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TNRQ92752 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms