Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCSTNQ92542 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCSTNQ92542 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCSTNQ92542 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms