Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM3CQ92520 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM3CQ92520 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM3CQ92520 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms