Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASKIN2Q8WXE0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASKIN2Q8WXE0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASKIN2Q8WXE0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms