Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD1

RAB2B, Ras-related protein Rab-2B, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2BQ8WUD1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB2BQ8WUD1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB2BQ8WUD1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms