Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2AF1L4Q8WU68 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2AF1L4Q8WU68 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms