Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SSH3Q8TE77 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SSH3Q8TE77 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SSH3Q8TE77 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SSH3Q8TE77 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SSH3Q8TE77 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SSH3Q8TE77 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SSH3Q8TE77 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SSH3Q8TE77 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SSH3Q8TE77 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SSH3Q8TE77 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SSH3Q8TE77 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SSH3Q8TE77 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SSH3Q8TE77 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SSH3Q8TE77 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SSH3Q8TE77 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SSH3Q8TE77 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SSH3Q8TE77 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SSH3Q8TE77 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SSH3Q8TE77 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SSH3Q8TE77 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SSH3Q8TE77 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SSH3Q8TE77 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SSH3Q8TE77 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SSH3Q8TE77 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SSH3Q8TE77 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SSH3Q8TE77 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SSH3Q8TE77 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SSH3Q8TE77 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms